Baru pada 2016 dia pertama kali jadi pelatih kepala di Madiun Putra yang berlaga di ISC B.
Kariernya terus naik sampai akhirnya dikasih amanah melatih Timnas Indonesia U-16 pada 2024. Dari situ lah cikal bakal tim U-17 yang kemudian tampil di Piala Dunia U-17 2025.
Dan sekarang, Nova Arianto siap melangkah lebih jauh bareng Timnas U-20.